曹知州率雅州军到达嘉定后不久，纽璘便下令开始进攻。蒙军的进攻还是老套路，先是攻城器械猛攻然后是步兵攻城。攻城的主力自然是新附军和眉州、雅州两军，蒙古骑兵仍然是督战队。嘉定城地势险峻，自蒙古人1242入侵四川以来从未失陷于敌人，可见其易守难攻的程度。这一次蒙军在嘉定城下仍然是举步维艰，将蚁附攻城、挖地道、火烧烟薰等办法统统用上，除了死伤一地外并无进展，反倒被嘉定军毁了不少攻城器械。
在半个月的攻城战中，蒙军仅有两次攻到了城门口。一次是刘大耳受霹雳军战法的启示，派了敢死队背负黑火药冲向城门，并成功地放置了数十斤黑火药。一声巨响过后，虽然嘉定城门被炸烂，蒙军却赫然发现城门洞早已被堵死。另一次则是曹知州成功忽悠了夷蕃士兵去攻城，他许诺若城破之后允许他们抢劫三天，所抢都归自己。这些在洪雅和夹江县尝到甜头的蛮兵那里听得这种话，当即便嗷嗷冲往城门，只不过也是止步于城门口。在城门被炸烂之后，俞三便在城门口埋了地雷，将这些夷蕃蛮兵炸得血肉横飞。
嘉定城的水门是城墙最薄的位置。在之前的历次攻城战中，由于蒙军并不擅长水战，这里反倒成了嘉定城防御最强的地方。今日不比以往，刘大耳的背叛让蒙军有了足以战胜嘉定水军的水上力量。只不过在城墙上的火力支援下，嘉定水军仍勉力抗住了眉州水军对水门的进攻。在陆上战局进入僵持的情况下，攻守双方都意识到嘉定城的得失系于水战的成败。面对僵局，纽璘只得一再遣信使前往成都，催促刘黑马派水军前来增援。
率领水军从成都南下嘉定的蒙军将领叫石抹按只，他同刘黑马一样同样是契丹人，曾在纽璘大破叙州都统张实的马湖江战役中建有奇功，是蒙军之中少有精通水战的将领。当石抹按只远远望见彭山城之时，便命船队停了下来。虽然刘黑马告诉他彭山城已归降，斥候船也回报说城头升起了蒙军旗帜，也有小船准备前来引导，但一向小心的他还是命令全军做好战斗准备。此次他带了大大小小战船二百余艘，有水军士兵一千五百人，沿着锦江排成了长长的一列，足足有二里多长。这可是刘黑马花了一年时间，耗费了大量的资源重建的水军。如果一旦损失，川西蒙军便再无可能在短时间重建水军了。
谨慎的石抹按只派了小校前往彭山城中，要求周见深前往其座船商议军务，并一同前往嘉定前线面见纽璘。小校还说彭山居于咽喉要地，驻军和船只不宜轻动，以防霹雳军来袭，只需周见深带几名亲随乘小船来石抹按只座船即可。坐镇城中的黄大根一听这个要求，便知道这个对手不好相与。这个石抹按只是个老狐狸，他那里是要与周见深商议军务并面见纽璘，分明是让周见深前去做人质，以让蒙古水军船只安全通过彭山城。
等了多时，彭山城水寨才有小船载着几人往蒙军船队而来。此时蒙军船队仍在锦江之中，离岷江水道的彭山城约有三里地，而石抹按只座船在蒙军船队的中央，离彭山城则有四里地之遥。待小船走到蒙军船只的前队，石抹按只看见小船上挂着一面绣着“周”字的旗帜，心安了不少。新附军将领降蒙时，需要随同投名状，将个人的生辰、籍贯、相貌等信息一并报与蒙军，周见深也不例外。而且为了不让刘大耳怀疑，参谋部并未胡乱描述周见深相貌，只是描述有些粗概。
当彭山城的小船离座船还有数十米之远时，石抹按只看了站在船头的领头之人，模样倒与投名状描述周见深相貌一致，当下心中大定，便也放松警惕下来。只不过旁边船上的一名蒙军小校突然大声命令小船停止前进。这小校的大声叫嚷，让石抹按只颇为不悦，正想斥责之时，却看见小船加速冲来。这小船上共有五人，除了站在船头之人外，其余四人皆拼命划桨前行。只不过这小船虽然外形是快船，但吃水颇深前进速度并不快，此时离石抹按只的座船仍有三十余米。
石抹按只正在疑惑之时，刚才叫嚷停船的蒙军小校凄厉地哭喊道“爆破船”，说完便猛然跳入水中，拼命向岸边游去。这名小校在上次彭山水战中侥幸逃生，见识过霹雳军爆破船毁天灭地的威力。他的哭喊让其余蒙军如梦初醒，有的四处乱窜，有的慌不择路地跳入水中，也有人朝小船攻击。石抹按只也听说过霹雳军爆破船的威力，此次也准备了不少敢死船准备阻截爆破船。只不过千算万算，他还是没有算到霹雳军会利用这种方式来袭击。来不及懊悔，石抹按只转身便转入船舱之中。为了防止火炮攻击，他的座船不仅木料极为厚实，还有一个船舱安装了厚铁板。
由于霹雳军的爆破船穿行在蒙军船只之间，蒙军射来的弩炮和弓箭，大部分矢石命中的反倒是己方大船，只有少数击中了目标，但也让爆破船停了下来。此刻的爆破船己是伤痕累累，船体中了一发弩炮，船舱已缓缓进水。站立在船头之人，全身已中了十余支箭，活脱脱成了一只刺猬，此刻他正伏船舱之中的大铁球上，一边拉动了引信，一边低声让剩下的两名水手逃走。刚才那四名划桨的水手已有两名被射死。这两名水手眼见引线已开始冒烟，便咬咬牙哭喊道：“班长来生我们再做兄弟”，说完便转身纵入水中。
霹雳军爆破船上的几人并非是周见深及其护卫，而是水军爆破船连的士兵。当石抹按只提出让周见深做人质后，黄大根想到的是借此次机会，让石抹按只搬起石头砸自己的脚，而要取得最大的战果，非爆破船莫属。只不这个任务并没有让周见深承担。一方面他率领的是步兵营，士兵并不擅长水上作战；另一方面也是因为爆破是一门非常专业的技术，短时间内根本无法学会，更不说要精通了。故黄大根将任务交给了水军旅爆破船连。
爆破船连往往执行的是自杀性任务，死伤率往往在百分之九十以上，非心怀必死信念的勇士不能担任，故士兵都是自愿报名。力的作用的相互的，压迫越深仇恨便越深，反抗就会越激烈。蒙军的残暴杀戮造就了太多要报家仇国恨之勇士，他们苟且偷生活在世上，唯有的信念便是向蒙军复仇，以血债血还。乐全安最初只想成立一个爆破船连，结果报名的实在太多，不得已只好成立了两个爆破船连。执行此次任务，由于竞争者太多，最后还是采用抓阄的方式才确定了人选。