8月20日，北京来电话，要叶飞速去北戴河。他立即乘专机赶去。21日下午3时，派人找叶飞去他的住处。叶飞一见到主席，就详细汇报了炮击金门的准备情况，炮兵的数量和部署，以及实施突然猛袭的打法。彭德怀、也参加了汇报会。
一面听叶飞汇报，一面看地图，精神非常集中。汇报完后，突然提出这么一个问题：“你用这么多的炮打，会不会把美国人打死呢？”
那时，美国顾问一直配备到国民党部队的营一级。叶飞回答说：“哎呀，那是打得到的啊！”
考虑了十几分钟又问：“能不能不打美国人？”
“主席，那无法避免！”
听后，再也不问其它问题，也不作什么指示，就宣布休息。大家知道，这是要进一步考虑问题了。
晚饭后，王尚荣拿了一张条子给叶飞，那是写给的。这个人很会捉摸的意图，他知道很注意能否避免打到美国人问题，所以写了这个条子提出：是否可能通过王炳南（正在华沙同美国进行大使级谈判）给美国透露一点消息。此人也有点莫名其妙：告诉美国人就等于告诉台湾，这怎么行呢？
看到条子，叶飞很吃惊，便问王尚荣：“主席把这信交给我看，有没有什么交代？
是不是要我表态？”
“主席没说什么，只说拿给你看。”
第二天继续开会。下决心了，看来没有理睬的建议。
他说：“那好，照你们的计划打。”并要叶飞留在北戴河指挥，跟彭德怀在一起住。
究竟是什么意思？叶飞不懂，也不好问。彭德怀也没派参谋来叫他住到他那里去。
晚上叶飞散步后回到房间里，正在发愁，恰好王尚荣来，他说：“老兄，主席不是交代你住到彭老总那里吗？”
叶飞说：“我哪好去往啊？！”
王知道叶飞为难，就说：“我替你想个办法，把专线电话架到你的房间里。”这下就解决问题了。
他们商定，前线直接同叶飞通话，叶飞再通过王尚荣转报，的指示也由王尚荣转告叶飞。叶飞问：“彭老总那里怎么报告呢？
主席交代我同他住一起的呀！”他说：“你别管了，此事由我办。”
所以，炮击金门是在北戴河指挥的。也可以说是直接在指挥。前线则由张翼翔、刘培善代叶飞指挥。